曲霉菌病是一种人畜共患的真菌性传染病，许多禽类和哺乳动物都能感染，往往造成发病和死亡。引起禽类曲霉菌病主要有烟曲霉和黄曲霉，因其没有有性繁殖阶段，分类学上属于半知菌纲，丛梗孢目，丛梗孢科。曲霉菌分布广泛，常见于腐烂植物、烟尘及饲料中。我国的饲料卫生标准规定，饲料原料中霉菌总数允许量不得超过4万/g，4～10万/g为限量饲用，超过10万/g为禁用饲料。
鸵鸟曲霉菌病临床可分为五个型，以肺型、眼型、脑型为多见。尤其是肺型霉菌病比较多见，其发病率高，治疗难度大。皮炎型和骨型较少见。
1 肺型曲霉菌病
鸵鸟曲霉菌病以本型发病为最多，临床表现为精神沉郁，眼半闭，食少或拒食，呼吸困难，张口呼吸，呼气时两侧翅膀抖动，气管发出咯咯的音响。
死亡剖检：支气管粘膜有炎症，肺内有黄白色结节，质地柔软有弹性或硬如软骨样，切面呈均质干酪样物。气囊内壁增厚，壁内有大小不等白色干酪状物。取其病料在马铃薯培养基培养，可见到菌丝有隔，气生菌丝的一端膨大成球球形顶囊，顶囊部生成小梗，小梗产生分生孢子，呈放射状排列。
治病以清肺解毒，散郁祛痰为治则，选用《元亨疗马集》中的"百合散"加味，配合使用制霉菌素，每日3次，连服7d。
处方：百合50g，贝母40g，大黄30g，黄芩30g，花粉30g，桔梗30g，冬花30g，甘草10g，胆矾30g，研末1次灌服。
方解：处方选用百合润肺止咳，贝母化痰止咳，清热散结为主药。辅以大黄除瘀热而降疾，黄芩泻肺火而消痛，款冬花润肺下气，化痰止咳，花粉清利咽喉止咳。佐以胆矾治风疾，甘草调和诸药。用桔梗作使药，"桔梗似舟楫，载诸药上行"，尚有开宣肺气，祛痰排脓的功能。
2 眼型霉菌病
发病率仅次于肺型霉菌病。临床表现羞明流泪，先流出浆液分泌物，后期流出粘性或干酪样的分泌物，有一侧发病，也有两侧同时发病。结膜潮红，肿胀，有的病例在角膜形成白色云翳，瞬膜水肿，严重者整个眼球发炎，继而导致失明。取其分泌物进行采样培养，发现大量曲霉菌。
治疗以清肝明目，退翳为治则，选用《元亨疗马集》中的"
处方：石决明20g，草决明20g，枝子20g，龙胆草20g，大黄15g，黄芩10g，郁金10g，密蒙花10g，蝉蜕10g，甘草10g，煎汤灌服，外用黄连煎汤过泸洗眼。
方解：处方中选用石决明，草决明清肝明日为主药，选用龙胆草苦寒入肝清热燥湿，枝子清泻三焦火，大黄泻火凉血，黄芩清热燥湿为辅药。郁金凉血清心利胆，密蒙花清肝热，明目退翳，蝉蜕祛风解痰，退翳明日为佐药，甘草调和诸药。
3 脑型霉菌病
本型临床主要表现为精神恐慌，易惊恐，步态不稳，头歪向一侧，斜颈，有时用头顶在墙壁，严重时头向后弯，体温升高39.5～41℃，严重时口吐涎沫，肌肉抽搐，甚至倒地死亡。死后剖检，脑膜血管充血，个别病例有局灶性脓肿。
治疗以清心解痉，重镇安神为治则。选用《千金方》中的"神曲散"加味，配合使用制霉菌素，每日3次，连服7d。
处方：神曲100g，磁石50g，朱砂10g，钩藤10g，二冬20g，研末1次灌服。
方解：处方中以磁石益阴潜阳，镇摄安神为主药。辅以朱砂清心安神，钩藤熄风止痉，清热平肝。用神曲健脾以助消化，使药不碍胃气。有利药力之运行，二冬润肺滋肾，养阴清热为佐使药。