黄眼企鹅是岛屿特有物种，在新西兰南部地区发现，包括斯图尔特岛、南岛、奥塔哥半岛、奥克兰群岛、坎贝尔岛和该地区的其他一些岛屿。这些企鹅不迁徙，并且全年都在此范围内。

黄眼企鹅是一种中型企鹅，它们是不生活在南极的最大的企鹅。一般身高56-78厘米，体重约5-8千克。其特征就是它们的黄眼睛，用于区分同是头上有黄色羽毛的其他成年企鹅和幼年企鹅。该物种表现出性二态性，雄鸟具有类胡萝卜素衍生的装饰物。雄性和雌性的差异可以从头上羽毛的色素沉积中看出，雄性头部呈更为明亮的黄色。黄眼企鹅身体呈黑色，颚及喉咙呈黑褐色。眼睛之间有一黄带在头后部连接。瞳孔呈淡黄色。 雏鸟的头部较灰，并没有黄带，而瞳孔亦是呈灰色的。大约一岁左右，直到幼企鹅蜕毛才出现黄色羽毛。

黄眼企鹅是是留鸟，通常在一个固定的地区居住，狩猎时除外。它们不是聚居地企鹅，这意味着它们不能与其他企鹅成群居住。 [4]这些鸟通常留在岸上，当需要觅食时，它们只在离海约7-13千米的地方活动，并在大陆架上捕猎。 黄眼企鹅主要在海底觅食，占所有潜水的87%，而浮游潜水则主要发生在它们返回繁殖区时。它们偶尔潜入的深度超过120米，但主要在小于100米的深度觅食。个体有觅食地点，它们会在随后的觅食旅行中甚至数年之间重新造访原来的觅食区。它们似乎对底栖觅食生境的干扰和退化非常敏感。 [3] 黄眼企鹅一般会在离岸7-13公里及巢穴以外的17公里处觅食。它们会在清晨离开巢穴，花2-3日的时间在海中觅食，若要哺育雏鸟的话，则会在即日的晚上回到巢穴。它们一般可以潜至34米的水深处。 在新西兰当地的毛利人把黄眼企鹅称作“Hoiho”，意思是大嗓门，因为它们的叫声尖锐且刺耳。黄眼企鹅的叫法是伸长脖子对天大叫，叫时胸肌一鼓一鼓的，且通常一对一分站四方，面对面引吭高歌，乍看像吵架，但这却是它们沟通的方式。当它们不叫时又挺相亲相爱的，常常交头接耳，磨磨蹭蹭。潜在伴侣通过尖锐的声音进行声音交流。巢穴通常被很好地隐藏起来，这种呼唤是用来让伴侣以及彼此寻觅的。由于它们的孤立性，它们没有受到其他企鹅的太多社会刺激，因此很容易被人类惊吓。 黄眼企鹅约90%的食物都是鱼类，余下的是头足纲。食物主要由小型鱼类组成，无论是幼鱼还是成年个体很小的物种。包括单鳍双犁鱼（Hemerocoetes monopterygius）、红拟褐鳕（Pseudophycis bachus）、新西兰拟鲈（Parapercis colias）、长体水珍鱼（Argentina elongata）和蓝背黍鲱（Sprattus antipodum）。它们也分别吃软体动物和一些甲壳类动物，包括新西兰箭鱿（Nototodarus sloani）和澳大利亚磷虾（Nyctiphanes australis）。它们的狩猎大多发生在大陆架边缘的新西兰沿海，使它们成为海洋捕食者。其觅食行为取决于繁殖季节。 未繁殖的企鹅走得更远，以狩猎为生。黄眼企鹅的离岸旅行相对短于其他类似规模的企鹅。